Bolognesi (2007)
Abril del 2007, Juan Reynoso era presentado como el nuevo técnico de Bolognesi, luego de tres años de haberse retirado del fútbol profesional: terminó su trayectoria como futbolista en el Club Necaxa donde jugó hasta el 2004. En Tacna, el entrenador peruano obtuvo el título del Torneo Clausura 2007 y la clasificación a la Copa Libertadores 2008 por primera vez en el club tacneño.
Además, de los 56 partidos que disputó con la institución (2007-2008), ganó 21, empató 16 y perdió 19, logrando una efectividad del 51.64%. Aún cuando empezó con el pie izquierdo, tras caer en su debut contra Universitario de Deportes.
Su primer partido fue el 29 de abril en el estadio Jorge Basadre. El marcador terminó 2-3 a favor de los cremas gracias a Johan Fano (16′), Mayer Candelo (35′) y Hector Hurtado (89′). Los del descuento los marcaron Paul Cominges (5′) y Juan Barros (81′). El encuentro culminó con diez hombres en cada equipo: Javier Chumpitaz y Antonio Gonzales fueron expulsados a los 82′.
Universitario de Deportes (2009)
En diciembre de 2008 Juan Reynoso llegó a Ate para ser el nuevo técnico de Universitario de Deportes, donde permaneció hasta junio del 2010: renunció al cargo a causa de los diversos problemas dirigenciales. En este periodo de tiempo, el estratega disputó 80 partidos: ganó 38, perdió 19 y empató 23. Su efectividad fue de 57.08%.
En cuanto a su debut, al igual que en Bolognesi, obtuvo un resultado negativo, aunque no fue en el torneo local, sino por la fase de grupos de Copa Libertadores: cayó 2-1 con Libertad el 11 de febrero del 2009. Aquella temporada, en el torneo internacional, la ‘U’ llegó a la última fecha casi clasificada a la siguiente ronda. Solo debía empatar o perder por un gol, pero San Lorenzo se la puso difícil y cayeron 2-0 en el Nuevo Gasómetro.
En el torneo local el equipo fue el puntero durante casi todo el campeonato. Logró su boleto a la liguilla final y obtuvo el título nacional venciendo en los ‘Play off’ a Alianza Lima. Además, Juan fue considerado como el mejor entrenador del 2008. El siguiente año, con la partida de Nolberto Solano a Inglaterra no tuvo la misma suerte.
Juan Aurich (2010)
Dos meses después de dejar el club crema, Reynoso fue presentado en Juan Aurich, donde apenas dirigió cuatro meses debido a los problemas internos de la institución. En total, estuvo al mando del equipo en 17 partidos, ganó ocho, empató 3 y perdió 6.
Su debut fue ante Sport Boys por goleada 4-1 el 11 de septiembre del 2010. Su equipo estuvo conformado por Jorge Rivera; Willy Rivas (Luis Tejada), Édgar Balbuena, Jesús Álvarez, Nelinho Quina; Gianfranco Espejo, Rinaldo Cruzado, William Chiroque, Ricardo Ciciliano; Pedro Ascoy e Ysrael Zúñiga.
Los goles fueron de Ciciliano (24′), Zúñiga (70′, 79′), Tejada (90′). Michael Guevara (52′) anotó para los chalacos. Mientras que Mario Gómez fue expulsado a los 82 minutos.
Sporting Cristal (2011)
Su paso por Sporting Cristal fue de los más bajos de su carrera. En el mes de abril del 2011, Reynoso fue nombrado DT del elenco celeste en reemplazo del argentino Guillermo Rivarola. Sin embargo, en el Rímac nunca pudo tener regularidad y en el Torneo Intermedio de dicha temporada cayó eliminado en semifinales por el José Gálvez, equipo de la Segunda División.
En tanto, en el torneo local, el plantel nunca funcionó y se mantuvo lejos de los primeros lugares. Su efectividad apenas fue del 40.23%. Jugó 23 partidos, perdió 10, empató 11 y solo pudo ganar en ocho oportunidades. ¿Su debut? Tampoco fue positivo. Empató sin goles ante Universitario de Deportes en el estadio Alberto Gallardo el 15 de mayo del 2011.
Melgar (2014)
Con Melgar tampoco pudo empezar con el pie derecho. Cayó 1-0 ante UTC en Cajamarca el 15 de febrero del 2014. Incluso, en dicho encuentro, el estratega terminó siendo expulsado. No obstante, el equipo rojinegro logró remontar en el campeonato, y quedó tercero en la Copa del Inca; en el Apertura fue subcampeón y en el Clausura ocupó el tercer lugar. En el acumulado quedó primero, clasificando a la Copa Sudamericana.
El siguiente año fue su mejor temporada al mando del club. Logró su clasificación a las semifinales de los playoffs, tras derrotar a Juan Aurich en Arequipa por 4-1 en la última fecha del Torneo Clausura. Posteriormente, ganó el Clausura tras vencer a Real Garcilaso en definición por penales, con un marcador de 4-2 tras igualar 1-1 en el tiempo.
En la semifinal, volvió a derrotar a Real Garcilaso, con marcadores de 1-0 (ida, en Arequipa) y 4-0 (vuelta, en el Cusco). Y en la final, se enfrentó a Sporting Cristal, campeón de la temporada anterior, arrebatándole el título en el año de su centenario, tras 34 años de sequía. El 2016 los rimenses se cobrarían el campeonato.
Melgar fue el equipo que más tiempo tuvo a su cargo Reynoso. Disputó 190 partidos en los que obtuvo 86 victorias, 52 empates e igual número de derrotas: 54.38% de efectividad.
Real Garcilaso (2019)
Con Real Garcilaso, Juan Reynoso sí pudo festejar el día de su debut. Venció 0-1 a Sport Huancayo con gol de Cristian Souza (15′), en condición de visita el 30 de marzo del 2019. El ‘Ajedrecista’ empezó con pie derecho su aventura en el cuadro cusqueño, pero terminó renunciando luego de 18 partidos tras una propuesta del Puebla para dirigir en la Liga MX. Con el actual Cusco FC, ganó nueve partidos, empató cinco y perdió cuatro.
Puebla (2019)
Su primer debut como técnico de un equipo internacional fue de ensueño. Juan Reynoso superó 2-1 a Juárez el 29 de agosto de 2019. Aún cuando empezó el partido perdiendo, tras un gol de Dario Lezcano a los 45′+1. En el complemento, Matías Alustiza (72′), Lucas Cavanili (90′+2) le dieron la alegría volteando el partido.
Con la ‘Franja’, Juan Reynoso disputó 46 partidos, ganó 16, empató nueve y perdió 21. Su efectividad fue del 41.3%, hasta que dio el salto a Cruz Azul.
Cruz Azul (2021)
Su último debut como técnico antes de retornar al Perú para vestir el buzo de la selección peruana fue con Cruz Azul en una derrota por 1-0 ante Santos Laguna el 11 de enero del 2021. No obstante, dicho partido no significó nada para todo lo que consiguió con ‘La Máquina’.
Aquel año, Juan Reynoso los devolvió a la gloria después de 23 años, disputó 74 partidos y ganó 36 (empató 20 y perdió 18), fue elegido el mejor entrenador del Torneo Guardianes, técnico del equipo All-Star de la Liga Mexicana, recibió el balón de oro al mejor DT de la Liga MX y nominado a mejor entrenador de clubes del Mundo, según IFFHS.
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